Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Trim13-201ENSMUST00000039562 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Dnm2-203ENSMUST00000115404 3455 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 2900076A07Rik-201ENSMUST00000180385 914 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Epdr1-203ENSMUST00000220944 563 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mterf2-201ENSMUST00000050813 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Mrpl47-201ENSMUST00000043966 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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