Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Apoh-201ENSMUST00000000049 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 A230059L01Rik-201ENSMUST00000126596 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Idh3g-201ENSMUST00000052761 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Clcn1Q64347 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Enox2-203ENSMUST00000114912 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm16212-201ENSMUST00000136190 282 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm37539-201ENSMUST00000192644 235 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC166358.1-201ENSMUST00000220677 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC153662.2-201ENSMUST00000221097 120 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC156037.2-201ENSMUST00000221284 112 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC166341.6-201ENSMUST00000221528 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 CT030242.1-201ENSMUST00000221945 125 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC124772.2-201ENSMUST00000222049 154 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC153663.1-201ENSMUST00000222165 120 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC127242.2-201ENSMUST00000223138 148 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Dennd2d-204ENSMUST00000183271 2050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Acad11-207ENSMUST00000189998 2030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Rbm43-202ENSMUST00000102768 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Clcn1Q64347 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms