Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc18Q640L5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms