Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm17382-201ENSMUST00000108741 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Hk1os-202ENSMUST00000142968 343 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm13645-201ENSMUST00000145163 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Tmem52b-204ENSMUST00000204741 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mbl2-201ENSMUST00000025797 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Atg12-201ENSMUST00000035648 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mpp2-202ENSMUST00000100398 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Timeless-206ENSMUST00000105245 4402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Nim1k-201ENSMUST00000178142 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Zscan5b-201ENSMUST00000072662 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 4933427E13Rik-202ENSMUST00000125234 1493 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Optn-201ENSMUST00000027986 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 C1galt1c1-201ENSMUST00000058265 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm26521-201ENSMUST00000181576 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Pfkfb2-213ENSMUST00000191347 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 E230016K23Rik-201ENSMUST00000125626 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm11377-201ENSMUST00000131539 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm22871-201ENSMUST00000177097 54 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 D330041H03Rik-206ENSMUST00000181259 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mrgpra6-202ENSMUST00000186456 1090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm4208-201ENSMUST00000189802 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 BC085271-202ENSMUST00000195236 867 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Igkv9-119-201ENSMUST00000200307 353 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Mrgpra6-201ENSMUST00000073793 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm9770-201ENSMUST00000075147 811 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms