Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1821-201ENSMUST00000111388 685 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl17-ps8-201ENSMUST00000118924 621 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15368-201ENSMUST00000120438 858 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11635-202ENSMUST00000139424 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17084-201ENSMUST00000163843 511 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29630-201ENSMUST00000185761 359 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45126-201ENSMUST00000206702 960 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1b1-201ENSMUST00000078835 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5d2-203ENSMUST00000156294 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp2-204ENSMUST00000107759 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms