Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nphp4P59240 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms