Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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Sh3bp1P55194 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
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