Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nedd1P33215 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms