Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Ugt1a6b-202ENSMUST00000113138 2303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm15925-201ENSMUST00000120641 1881 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Zg16-202ENSMUST00000205424 682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tmem18-201ENSMUST00000057151 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Atf7-203ENSMUST00000169033 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm16212-201ENSMUST00000136190 282 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms