Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Xntrpc-201ENSMUST00000084843 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc180J3QNE4 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms