Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd2V9GX34 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd2V9GX34 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms