Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm26992S4R1A3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm26992S4R1A3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm26992S4R1A3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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