Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac5Q9Z2V6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdac5Q9Z2V6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms