Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac6Q9Z2V5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac6Q9Z2V5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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