Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms