Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfrp4Q9Z1N6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms