Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pf4Q9Z126 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pf4Q9Z126 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Pf4Q9Z126 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Pf4Q9Z126 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pf4Q9Z126 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pf4Q9Z126 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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