Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dctn3Q9Z0Y1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms