Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NgfrQ9Z0W1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms