Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xpr1Q9Z0U0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Xpr1Q9Z0U0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms