Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip2Q9Z0H8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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