Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin2Q9WVE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pacsin2Q9WVE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms