Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf13bQ9WU72 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms