Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b2Q9R0K7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b2Q9R0K7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms