Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zeb2Q9R0G7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zeb2Q9R0G7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms