Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nubp2Q9R061 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nubp2Q9R061 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms