Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp11cQ9QZW0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp11cQ9QZW0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms