Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rnf4Q9QZS2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Rnf4Q9QZS2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnf4Q9QZS2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms