Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndrg3Q9QYF9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms