Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VapbQ9QY76 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VapbQ9QY76 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms