Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Irx4Q9QY61 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx4Q9QY61 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms