Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nphp1Q9QY53 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nphp1Q9QY53 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nphp1Q9QY53 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms