Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc7a8Q9QXW9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc7a8Q9QXW9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms