Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms