Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trip4Q9QXN3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip4Q9QXN3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms