Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad18Q9QXK2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms