Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apbb1Q9QXJ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apbb1Q9QXJ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms