Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChmQ9QXG2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms