Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms