Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PdcQ9QW08 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdcQ9QW08 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdcQ9QW08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms