Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcea2Q9QVN7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcea2Q9QVN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms