Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mid2Q9QUS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mid2Q9QUS6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms