Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cln8Q9QUK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms