Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csnk1eQ9JMK2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.8 ms