Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txnrd1Q9JMH6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Txnrd1Q9JMH6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txnrd1Q9JMH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms