Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmub1Q9JMG3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmub1Q9JMG3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms