Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms