Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cabp1Q9JLK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cabp1Q9JLK7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cabp1Q9JLK7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms