Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LitafQ9JLJ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LitafQ9JLJ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms