Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pkd2l2Q9JLG4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms